業務簡介
船舶組下設技術科、船籍管理科及船舶規劃科，辦理船舶檢查丈量與船舶登記註冊督導業務、相關法規研議擬訂及船舶政策發展規劃業務，其掌理事項如下：

 技術科：
一、船舶管理法規之訂定、修正與廢止之擬議

二、船舶安全管理與查核督導

三、港口國管制業務督導

四、船舶之建造、改造、修理之核議

五、船舶檢查、丈量與載重線勘劃事項督導

六、小船檢查、丈量、吃水尺度勘劃事項督導

七、船舶技術規範及檢查技術標準之研訂、核議

八、船舶技術人員訓練

船籍管理科：

一、船舶管理法規之訂定、修正與廢止之擬議

二、船舶登記事項（所有權、抵押權、租賃權之保存、設定、移轉、變更、限制、處分或消滅等）督導

三、小船註冊事項督導

四、遊艇登記與註冊事項督導

五、船舶購建事項之審核

六、船舶抵押、出售及拆解事項之核定

七、非中華民國國籍船舶申請進入非國際港灣口岸之特許

八、船舶資料之蒐集與統計資料之處理

船舶規劃科：

一、船舶管理法規之訂定、修正與廢止之擬議

二、船舶國際公約之認可與施行之擬議審核

三、驗船師執業證書核(換、補)發、撤銷（或廢止）及註銷

四、特種船舶之管理

五、水運動員準備相關事項之擬訂及執行

六、船舶運送業及船舶出租業購置船舶設備免稅案件之核議