● 航業監理業務之執行
● 船員服務手冊、適任證書之核發、換發、補發作業及船員監理業務之執行
● 船舶檢查、丈量、註冊、登記、載重線勘劃業務之執行
● 海事案件之調查處理、打撈業務及海難救護業務監理業務
● 引水業務及引水人管理
● 航路標誌管理及維護之執行
● 商港公有公共基礎設施之維護及管理
● 自由貿易港區管理機關應辦理事項之執行
● 港區污染防治之裁罰
● 其他有關航政及港政事務之執行
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