國際海事組織(IMO)稽核目的為透過實地派員稽核機制,監督IMO準法律文件(包括國際海上人命安全公約及其議定書、國際防止船舶污染公約、航海人員訓練發證及當值標準國際公約及其章程、國際載重線公約、國際船舶噸位丈量公約及國際海上避碰規則)轉化為各會員國國內法之情形,並確保有效執行、執法。審核機制範圍不僅侷限於船旗國,亦將延伸到沿岸國和港口國的相關層面,本局前已於2014 年邀請資深稽核員來臺執行自願稽核業務。
為促進海事安全及保護海洋環境,本局主動配合IMO推行稽核機制,以期我國於船旗國、沿岸國及港口國各方面之管理均能與世界接軌,增進航商競爭力,並進而提高我國海事地位。