北部航務中心組織說明：本中心設有中心主任一名、中心副主任一名，簡任技正二名、專門委員二名。

中心所轄下屬單位計有：

監理科：負責航運業管理、船員管理、船舶進出港業務、資訊管理等相關業務。

海技科：負責船舶檢查、丈量及載重線勘劃、船舶登記、港口國管制檢查等相關業務。

港政科：負責公共基礎設施維護管理、港區污染防制、港區災害防救、貨物裝卸承攬業及理貨業監理、違反港務法規處分、自由貿易港區管理機關應辦理事項等相關業務。

航安科：負責海事案件處理及調查、引水業務及引水人管理、航船布告發布、檔案管理、財產管理等相關業務。

臺北航港科：負責船舶監理、船員監理、船舶進出港簽證、船舶檢丈、港口國管制、商港服務費等相關業務。

蘇澳航港科：負責船舶監理、船員監理、船舶進出港簽證、船舶檢丈、港口國管制、商港服務費等相關業務。